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EGFR T790M突变检测的技术进展
时间:2017-08-15   作者:AZD9291 【转载】   

  奥希替尼是一种不可逆的三代EGFR-TKI,可以选择性地抑制EGFR敏感突变和T790M突变。2017年3月,奥希替尼在华上市,开创了EGFR TKI耐药后T790M阳性患者的精准治疗新时代。随着泰瑞沙的上市,如何敏感、准确地检测T790M突变成为临床关注的热点。为此分别从以下4个方面进行系统梳理:EGFR T790M检测的重要性、检测标本的选择、检测方法学比较,以及血浆动态监测的价值。国际、国内的权威指南均推荐,所有EGFR TKI耐药后的患者,都应该进行T790M突变检测。那么应该采用何种方法进行T790M突变检测呢?本文将详细为您解答。

  泰瑞沙在华上市,拉开了T790M突变患者精准治疗新时代。指南推荐,对于EGFR-TKI耐药的患者,都进行T790M突变检测;组织活检是目前T790M突变检测的标准方法。对于部分无法取样的患者,可以尝试采用细胞学标本(如恶性胸水),血液标本(ctDNA)和尿液标本(ctDNA)作为补充手段。那么,目前T790M突变检测,我们有哪些检测方法呢?T790M突变检测主要分为3类:1. 非数字化ARMS法:如FDA批准的泰瑞沙伴随诊断Cobas® EGFR突变检测试剂盒V2(罗氏,石蜡组织切片和血浆);艾德ADx®-ARMS(石蜡组织切片)、Super-ARMS(血浆);和凯杰Therascreen EGFR kit/plasma RGQ PCR kit。2. 数字化PCR:常见的有赛默飞QuantStudioTM3D数字PCR系统;伯乐微滴式数字PCR;BEAMing数字PCR。3. 下一代测序技术,主要包括:Illumina和Ion Torrent(赛默飞)。

  (一)EGFR突变检测的伴随诊断平台

  目前,已经有多个基于PCR检测的诊断平台用于EGFR突变检测,包括cobas法、ARMS法、BEAMing法、数字PCR法、HRM法、DHPLC法、质谱分析基因分型、电场诱导释放与测量法(EFIRM)和二代测序(NGS)。以下总结了最常用的检测平台的主要性能。

  (二)EGFR T790M突变检测的技术比较

  上期我们提到目前国际、国内的权威指南推荐,应优先进行组织检测。(上期回顾:EGFR-TKI耐药后的检测标本选择:组织活检vs.液体活检)

  面对众多的检测平台,组织检测该选择何种方法呢?在奥希替尼的I期扩展队列中,中心实验室采用罗氏Cobas组织检测,EGFR T790M的阳性率为62%(138/222)。在三代EGFR TKI Rociletinib I-II期研究中,中心实验室采用罗氏Cobas组织检测或凯杰Therascreen,EGFR T790M的阳性率为53%(78/148)。EGFR-TKI耐药后患者再行组织检测,大部分采用的是活检穿刺的小标本,由于样本量较小且组织存在异质性,推荐采用较敏感的ARMS法,比如经过临床试验验证的Cobas。近年来,开发出一些高敏感度的检测方法,但进行组织检测时,需要警惕假阳性的可能。

  当组织样本不可及时,需要考虑其他样本比如血浆作为替代。目前血浆T790M突变检测的不同方法敏感性及特异性各有不同。Thress等人的研究对比了cobas法、BEAMing法、数字PCR法和ARMS法,结果显示在T790M突变检测上,数字检测平台的敏感度优于非数字检测法。在临床上,数字PCR能实现绝对定量,这是优于qPCR法的相对定量的,尤其是对于低丰度突变。在数字PCR对比ARMS法的研究中发现,数字PCR法的T790M突变率更高,分别为43.0%和25.2%,数字PCR法的检测下限为0.03%。另一个研究比较了NGS和cobas法对血浆中EGFR突变(EGFR exon19del,L858R和T790M突变)的定量检测,发现这两种方法存在较强的相关性(R2>95%, P<0.0001。因此,如果采用血浆进行T790M突变检测,推荐采用灵敏度相对较高的数字PCR或NGS平台。下表2,3总结了采用不同血浆检测平台进行EGFR T790M突变检测。

  对于EGFR TKI耐药的患者,应优先采用组织检测,推荐使用ARMS方法。但如果患者进行血浆T790M检测,推荐采用灵敏度相对较高的数字PCR或NGS平台,对于血浆检测T790M阴性的患者,应该再行组织检测加以验证。

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